Выявление молекулярных маркеров и генов-кандидатов породной принадлежности северокавказских мясо-шерстных овец методом полногеномного поиска ассоциаций

Криворучко А. Ю., Скокова А. В., Яцык О. А., Кухарук М. Ю., Лиховид А. А., Кизилова Н. И.
2024

Выполнен полногеномный поиск ассоциаций однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) с принадлежностью баранов к северокавказской мясо-шерстной породе. Для этого проведено генотипирование 275 голов овец российских пород с использованием ДНК-биочипов компании Illumina и детекцией 600 тыс. SNP. Группа «случай» была представлена животными северокавказской мясо-шерстной породы (n = 55), в группу «контроль» вошли животные таких пород, как карачаевская, романовская, джалгинский меринос и российский мясной меринос (по 55 голов каждой породы). В результате исследования было выявлено более 100 SNP с высокодостоверными различиями по частоте встречаемости (–log10(p) > 7) у овец северокавказской мясо-шерстной породы и пород сравнения. Для поиска генов-кандидатов породной принадлежности было отобрано 18 полиморфизмов с наиболее высокими показателями достоверности, локализованные на хромосомах 1, 10, 11, 15, 17. В пределах половины сантиморганиды от них было обнаружено одиннадцать генов: DEPDC1, RXFP2, EEF1A1, B3GLCT, FAM124A, FNDC3A, SLC25A5, CAMTA2, NLRP1, ALX4, TMEM132C. Эти гены мы считаем перспективными для дальнейшего изучения с целью поиска структурных особенностей, связанных с фенотипом северокавказской мясо-шерстной породы. Выявленные нами SNP могут быть использованы для молекулярно-генетической экспертизы при оценке породной принадлежности животных.

Криворучко А. Ю., Скокова А. В., Яцык О. А., Кухарук М. Ю., Лиховид А. А., Кизилова Н. И. Выявление молекулярных маркеров и генов-кандидатов породной принадлежности северокавказских мясо-шерстных овец методом полногеномного поиска ассоциаций. Известия Национальной академии наук Беларуси. Серия аграрных наук. 2024;62(1):57-67. https://doi.org/10.29235/1817-7204-2024-62-1-57-67
Цитирование

Список литературы

Похожие публикации

Источник