Дикетоны природного происхождения как потенциальные ковалентные лиганды белков SARS-CoV-2: исследование in silico методом докинга

Фалетров Я. В., Старовойтова В. А., Позняк Г. И., Шкуматов В. М.
2022

Компьютерный докинг, проведенный с использованием программы Autodock Vina, позволил выявить потенциал нескольких α- и β-дикетонов растений и других природных объектов в качестве ковалентных лигандов ряда белков коронавируса SARS-CoV-2 – возбудителя COVID-19. Выявлено, что энергией связывания (docking score, Ebind, ккал/мол) менее –7,5 с колоколизацией карбонильных групп на расстоянии не более 0,4 нм от атомов азота боковой цепи остатков аргинина белков коронавируса. β-Дикетоны 6-гингердион (код структуры по базе данных Pubchem CID162952), 8-гингердион (CID14440537), тетрагидрокуркумин (CID124072), а также α-дикетон валлитаксан E (CID132967478) обладали такими свойствами. Выявленные in silico взаимодействия указывают на возможность обнаружения их в эксперименте и исследования этих веществ или содержащих их природных материалов как средств борьбы с короновирусной инфекцией.

Фалетров Я. В., Старовойтова В. А., Позняк Г. И., Шкуматов В. М. Дикетоны природного происхождения как потенциальные ковалентные лиганды белков SARS-CoV-2: исследование in silico методом докинга. Известия Национальной академии наук Беларуси. Серия химических наук. 2022;58(3):280-285. https://doi.org/10.29235/1561-8331-2022-58-3-280-285
Цитирование

Список литературы

Похожие публикации

Источник