Оценка степени сродства ДНК-специфических лигандов-интеркаляторов бромистого этидия и метиленового синего с poly(rA), poly(rU) и poly(rA)-poly(rU)
Проведены исследования взаимодействия интеркаляторов метиленового синего (МС) и бромистого этидия (БЭ) с синтетическими одноцепочечными (оц) полинуклеотидами poly(rA) и poly(rU) и образовавшимся в результате их гибридизации двухцепочечным (дц) poly(rA)-poly(rU), при ионной силе раствора 0.04 моль, в интервале изменения соотношения r = фосфат/лиганд 0 ≤ r ≤ 10. Получены спектры поглощения комплексов лигандов с указанными полинуклеотидами, и на основании изменений спектров поглощения построены изотермы адсорбции в координатах Скэтчарда. Выявлено, что МС с poly(rA), а также с дц-poly(rA)-poly(rU) взаимодействует кооперативно, в то время как в случае poly(rU) кооперативность не обнаруживается. Кооперативность отсутствует и при взаимодействии БЭ с оц- и дц-полинуклеотидами. Из изотерм адсорбции определены параметры связывания этих лигандов с указанными полинуклеотидами — константы ассоциации K и число оснований n, приходящихся на одно место связывания, а также фактор кооперативности — при взаимодействии МС с poly(rA) и дц-poly(rA)-poly(rU). Выявлено, что оба лиганда с полинуклеотидами связываются по крайней мере двумя способами, при этом МС проявляет наибольшее сродство к poly(rA), а БЭ — к дц-poly(rA)-poly(rU).
