TY  - JOUR
T1  - Анализ взаимодействия пропиконазола с ДНК на основе расчетов методом функционала плотности и молекулярного докинга
JF  - Журнал прикладной спектроскопии
AU  - Kinaytürk N. K., 
Y1  - 2023-11-25
UR  - https://www.academjournals.by/publication/15386
N2  - Теоретический анализ, основанный на структурных и спектральных данных, использован для выяснения механизма молекулярного взаимодействия пропиконазола — фунгицида — с ДНК. Оптимизация, анализ полос колебаний и электронной структуры проведены с использованием теории функционала плотности уровней B3LYP с базисным набором aug-cc-pVDZ. Проведено моделирование молекулярного докинга для определения механизма и способов взаимодействия между пестицидом пропиконазолом и ДНК (ID PDB: 1BNA). Показано, что соединение проявляет реакционную способность и поляризуемость, на что указывает диапазон энергий ВЗМО-НСМО. Анализ поверхности молекулярного электростатического потенциала (МЭП) и поверхности электростатического потенциала молекулы показал, что атомы N6 и N7 обладают отрицательным потенциалом и служат активными центрами для нуклеофильных атак. Аналогичные наблюдения сделаны для атомов кислорода и хлора. Анализ молекулярного докинга показал способность лиганда пропиконазола связываться с ДНК в сайтах, включающих в себя атомы азота, кислорода и хлора, в частности, с взаимодействиями гуанин (G)-цитозин (C). Соответствие результатов MЭП и молекулярной вставки подтверждает сделанные выводы. Результаты дают ценную информацию о механизме повреждения ДНК и токсикологическом воздействии пестицида. В результате анализа молекулярного докинга выявлены изменения в оптимизированной структуре молекулы пропиконазола. Длина связи Cl1–C15, которая изначально составляла 1.73 Å в оптимизированной структуре, пересчитана как 1.77 Å после анализа молекулярного докинга.