МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ, РАСЧЕТЫ ДИМЕРА, КОЛЕБАТЕЛЬНЫЕ СПЕКТРЫ И ИССЛЕДОВАНИЕ МОЛЕКУЛЯРНОГО ДОКИНГА 5-ХЛОРУРАЦИЛА

Akalin E. , Celik S. , Akyuz S.
2019

Методом теории функционала плотности (DFT) в приближении B3LYP/6-31++ G(d, p) и wb97xd/6-31++ G(д, р) осуществлены расчеты структуры и колебаний 5-хлорурацила (5-ClU) и его наиболее стабильного димера. Колебательные расчеты мономерной и димерной форм проводились с использованием приближений гармонического и ангармонического осцилляторов с одинаковыми базисными наборами. Полный колебательный анализ молекулы выполнен путем объединения данных комбинационного рассеяния, ИК-Фурье-спектроскопии и квантово-химических расчетов. Проведен анализ докинга ДНК с молекулой 5-ClU. Молекула 5-ClU связывается с активным центром ДНК посредством водородных связей. Показано, что закрепленный лиганд образует стабильный комплекс с ДНК со сродством связывания -5.3 ккал/моль.

Akalin E. , Celik S. , Akyuz S. МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ, РАСЧЕТЫ ДИМЕРА, КОЛЕБАТЕЛЬНЫЕ СПЕКТРЫ И ИССЛЕДОВАНИЕ МОЛЕКУЛЯРНОГО ДОКИНГА 5-ХЛОРУРАЦИЛА. Журнал прикладной спектроскопии. 2019;86(6):858-867.
Цитирование

Список литературы

Похожие публикации

Источник