На основе анализа структурного комплекса нейтрализующего антитела VRC01 с белком gp120 ВИЧ-1 осуществлен виртуальный скрининг химических соединений, способных имитировать фармакофорные свойства антиген-связывающего центра иммуноглобулина. Методами молекулярного моделирования построены комплексы этих соединений с белком gp120, проведена оценка их потенциальной ингибирующей активности и рассчитаны свободные энергии образования надмолекулярных структур. В результате отобраны шесть соединений-лидеров, специфически и эффективно взаимодействующих с аминокислотными остатками белка gp120, критическими для его связывания с первичным рецептором CD4 клетки-мишени. Исходя из полученных данных, идентифицированные соединения рассматриваются как перспективные базовые структуры для создания новых лекарственных препаратов против ВИЧ с широким спектром нейтрализующего действия.
КАШИН И. А., ТУЗИКОВ А. В., АНДРИАНОВ А. М. ВИРТУАЛЬНЫЙ СКРИНИНГ НОВЫХ АНТИ-ВИЧ АГЕНТОВ – ПЕПТИДОМИМЕТИКОВ МОНОКЛОНАЛЬНОГО АНТИТЕЛА VRC01, ПРОЯВЛЯЮЩЕГО ШИРОКУЮ ВИРУСНУЮ НЕЙТРАЛИЗАЦИЮ. Доклады Национальной академии наук Беларуси. 2014;58(2):63-72.
1. Andrianov A. M. // Expert Opin. Drug Discov. 2011. Vol. 6. P. P. 419–435.
2. Sirois S., Sing T., Chou K. C. // Cur. Prot. Pept. Sci. 2005. Vol. 6. P. P. 413–422.
3. Engelman A., Cherepanov P. // Nature Rev. 2012. Vol. 10. P. P. 279–290.
4. Walker L. M., Burton D. R. // Cur. Opin. Immunol. 2010. Vol. 22. P. P. 358–366.
5. Kwong P. D., Mascola J. R., Nabel G. J. // Cold Spring Harbor Perspect. Med. 2011. Vol. 1. a007278.
6. McCoy L. E., Weiss R. A. // J. Exp. Med. 2013. Vol. 210. P. P. 209–223.
7. Zhou T., Georgiev I., Wu X. et al. // Science. 2010. Vol. 329. P. P. 811–817.
8. Floris M., Masciocchi J., Fanton M., Moro S. // Nucl. Acids Res. 2011. Vol. 39, suppl. 2. P. P. W261–W269.
9. Kwong P. D., Wyatt R., Robinson J. et al. // Nature. 1998. Vol. 393. P. P. 648–659.
10. Masciocchi J., Frau G., Fanton M. et al. // Nucl. Acids Res. 2009. Vol. 37, Database issue. P. P. D284–D290.
11. Trott O., Olson A. J. // J. Comput. Chem. 2010. Vol. 31. P. 455–461.
12. Абламейко С. В., Абрамов С. М., Анищенко В. В. и др. Суперкомпьютерные конфигурации СКИФ. Минск, 2005. – 170 с.
13. Durrant J. D., McCammon J. A. // J. Mol. Graph. Model. 2011. Vol. 29. P. P. 888–893.
14. Myszka D. G., Sweet R. W., Hensley P. et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2000. Vol. 97. P. 9026–9031.
